Il y a cent quarante ans, lors de la période mouvementée qui marqua la fin de l'ère Tokugawa, un samouraï nommé Battosaï l'assassin vivait à Kyoto. Tueur redoutable, il laissait derrière lui de véritables carnages, nourissant ainsi l'espoir de voir s'ouvrir une ère nouvelle. Mais alors que la guerre civile s'achevait, il disparut. Nul ne sait ce qu'il est devenu...